シーズン1-1 第1話
邦題:バルカンの挨拶
原題:The Vulcan Hello
あらすじ……時は23世紀。USSシェンジョウの副長マイケル・バーナム中佐は連邦辺境の連星系で正体不明の遺物を発見する。調査に向かった彼女は、遺物がクリンゴンのものである事を発見する。連邦は100年ぶりに好戦的なクリンゴン人と遭遇することとなった。
シーズン1-2 第2話
邦題:連星系の戦い
原題:Battle at the Binary Stars
あらすじ……多くのクリンゴン艦と対峙した状況で、先制攻撃を提案するマイケルはジョージャウ船長に職を解かれ拘禁されてしまう。緊張が高まる中、宇宙艦隊の船も現場に続々と到着するが、トゥクヴマ率いるクリンゴン艦隊が遂に連邦艦隊を攻撃、戦闘が始まってしまった。
シーズン1-3 第3話
邦題:支配する者
原題:Context Is for Kings
あらすじ……戦闘から6カ月後。服役中のマイケルを護送中のシャトルが、謎の生命体によってトラブルを起こす。そこへ宇宙船USSディスカバリー号が現われた。マイケルは副長となったサルーに再会するが、他の乗員からは悪名高い反逆者として厳しい視線にさらされる。ディスカバリー号の船長ガブリエル・ロルカは、マイケルをクルーとして復帰させ、ある任務を与える。
シーズン1-4 第4話
邦題:殺戮者のナイフは子羊の悲鳴など気にかけない
原題:The Butcher's Knife Cares Not for the Lamb's Cry
あらすじ……正式にクルーに迎えられたマイケルは、ロルカ船長からUSSグレンから回収したクマムシを見せ、調査するよう命じる。一方、ダイリチウム鉱山星コルバンがクリンゴンに襲われ、ディスカバリーは救難信号を受け取る。
シーズン1-5 第5話
邦題:我に苦痛を与えよ
原題:Choose Your Pain
あらすじ……クマムシの性質から得た胞子ドライブによって、USSディスカバリー号は特殊な船となった。艦隊司令部は、その重要性からディスカバリー号を戦闘の第一線から退くよう命じるが、会議の帰りにロルカ船長がクリンゴン艦に捕えられてしまう。彼はそこでハリー・マッドとアッシュ・タイラー大尉と出会う。
シーズン1-6 第6話
邦題:忘却の川
原題:Lethe
あらすじ……マイケルの養父であるバルカン人サレクは、クリンゴンの反乱分子に招待され秘密裏に中立地帯に向かっていた。だが、サレクの乗った船がバルカン論理至上主義者の手によって妨害工作に遭い、遭難してしまう。遠く離れたマイケルだったが、彼女はサレクの異変を感じ取っていた。
シーズン1-7 第7話
邦題:正気を狂気に変えるマジック
原題:Magic to Make the Sanest Man Go Mad
あらすじ……ディスカバリー号は宇宙空間で異星生物ゴーマガンダーを発見し船内に収容するが、中からなんとハリー・マッドが現れる。彼は胞子ドライブの秘密を盗もうとするが失敗。捕まったマッドは、ディスカバリー号ごと自爆してしまう。
シーズン1-8 第8話
邦題:汝、平和を欲するなら、戦いに備えよ
原題:Si Vis Pacem, Para Bellum
あらすじ……ディスカバリー号は、遮蔽装置を備えたクリンゴン船から襲われているUSSガガーリンの救援に向かうが失敗する。脱出したディスカバリー号は遮蔽を探知するため、強い電磁波を出す惑星パーヴォに向かう。調査に降り立ったマイケル、サルー、タイラーの三人は、そこで未知の生命体パーヴァンに出会う。
シーズン1-9 第9話
邦題:深き森の奥へ
原題:Into the Forest I Go
あらすじ……惑星パーヴォに現れた、遮蔽装置を持つクリンゴン船〝死者の船〟(サルコファガス)。惑星連邦はディスカバリー号に退却命令を出すが、ロルカ船長は遮蔽装置のデータを得る作戦を立てる。タイラーとマイケルはセンサーを設置するためクリンゴン船に潜入する。そこで囚人となったコーンウェル提督を発見する。
シーズン1-10 第10話
邦題:我の意志にあらず
原題:Despite Yourself
あらすじ……ディスカバリー号は鏡像宇宙に迷い込み、この世界のディスカバリー号と入れ替わってしまった。この世界はテラン帝国という名の暴力的な地球人類が統治しており、それに対抗するクリンゴンがバルカン、アンドリア、テラライトらと手を結んでいた。
シーズン1-11 第11話
邦題:内なる狼
原題:The Wolf Inside
あらすじ……マイケルはテラン帝国皇帝から命令を受ける。それは、反帝国軍のクリンゴン人指導者“ファイアウルフ”がいる星を滅ぼす事。だが、マイケルは命令に背き、タイラーと共に反乱軍基地に潜入する。マイケルはそこで“予言者”と呼ばれる鏡像宇宙のサレクと出会う。
シーズン1-12 第12話
邦題:大それた野心
原題:Vaulting Ambition
あらすじ……マイケルはテラン帝国の皇帝と会い、正体を明かして助けを求める。だが、皇帝は鏡像宇宙の事はすでに知っていた。実はかなり以前に、マイケルたちの世界からUSS(惑星連邦)の船が迷い込んできたからだ。だが皇帝は、その船では戻れないと語る。
シーズン1-13 第13話
邦題:過去は序章
原題:What's Past is Prologue
あらすじ……自らの正体を明かしたロルカは、反乱軍を率いてクーデターを起こす。一方、宮廷船が胞子ネットワークからエネルギーを引き出していたが、そのために全宇宙の生命が危機に陥ろうとしていた。ディスカバリーのクルーは阻止すべく決意する。
シーズン1-14 第14話
邦題:外なる戦い、内なる戦い
原題:The War Without, The War Within
あらすじ……無事に帰還したディスカバリー号だったが、元の宇宙では数ヶ月もの時間が過ぎていた。その間にクリンゴンとの争いは激化して、惑星連邦は領域の20%も失っていた。打開策を模索する中、ジョージャウ皇帝からあることを聞き出す。
シーズン1-15 第15話
邦題:新たなる旅立ち
原題:Will You Take My Hand?
あらすじ……ディスカバリー号は作戦のため、クリンゴンの母星クロノスにジャンプする。ジョージャウ皇帝率いる上陸班は、クロノスのとある居住地区に降り立った。今後の惑星連邦の運命を握るこの作戦だが、マイケルには連邦の理念に反しているように思えた。